交通部鐵道局辦理「台南市區鐵路地下化計畫(北區)」工程申請徵收台南市北區65筆土地及其土地改良物，內政部於2018年10月24日核准徵收。市府依土地徵收條例規定，自2018年11月6日起至2018年12月5日止辦理徵收公告30日，徵收土地範圍及應領補償費額將陳列於市府地政局及北區區公所公開閱覽，並以書面通知土地或土地改良物所有權人及他項權利人。

市府訂於2018年12月7、10-13日上午10時正至下午2時正，於台南市北區長榮里活動中心(住址：台南市長榮路5段41巷46號)辦理補償費發給，長榮新城住戶請依歸戶號排定領取時間領取(歸戶編號1-350：12月10日，歸戶編號351-700號：12月11日，歸戶編號701-1050號:12月12日，歸戶編號1051-1433號:12月13日)。

另補償費若低於新台幣20萬元者，可申請以匯款方式領取，以節省時間及交通成本，市府亦將於12月16日、12月23日上午10時正至下午2時正於長榮新城社區2樓管理室派員駐點，請受補償對象提供本人之存摺封面影本，並填具匯款申請書及攜帶應備文件申請。

符合照顧住宅申購資格之拆遷戶計286戶，已有215戶申購選位，其中157戶已完成交屋。市府對於可能遭到一併拆除戶，亦保留同樣有申購照顧住宅之權利。市府於2018年11月9日至2019年1月8日開放公告第三梯次申請，請尚未申購之拆遷戶，請儘速於公告期限內向市府都發局提出申請，以維護自身權益。