行政院長賴清德2010年當選台南市長，隔年因取消議員每年1200到1500萬元小型工程建議配合款，堅持錢要花在刀口上的理念，與時任市議會「無黨問政聯盟」總召吳健保槓上，府會陷入僵局。當時民意一面倒支持賴清德，賴最終也如願完成外界眼中的「不可能任務」。
賴清德當年堅持做對的事，不惜衝撞議會體制完成改革，他更公開闡明，會根據「需要、公平、公開」等3大原則，接受議員建議案，即須有實際需要、經費給予不分黨派、每3個月公開1次，他尋求議會支持也訴諸民意，「拜託給我1年時間做做看，做不好再杯葛也不遲！」
當時，以吳健保為首的「大台南無黨問政聯盟」為此批評賴清德傲慢、不尊重市議會。吳健保直言，議員爭取的是預算建議權，不是配合款，不滿賴清德將配合款汙名化，揚言賴若不道歉就沒完沒了，並杯葛議會進行。 賴清德堅持取消議員工程配合款，不只造成府會雙方嚴重對立，府會僵局長達約2個月，此一事件更引起全國輿論關注，除了民進黨力挺賴清德拒給議員工程配合款，甚至就連時任總統的馬英九、行政院長吳敦義也表達支持賴清德。